Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSIG1Q86XK7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG1Q86XK7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSIG1Q86XK7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VSIG1Q86XK7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG1Q86XK7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSIG1Q86XK7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms