Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARM1Q86X55 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARM1Q86X55 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CARM1Q86X55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARM1Q86X55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARM1Q86X55 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms