Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM220AQ7Z4H9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM220AQ7Z4H9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM220AQ7Z4H9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM220AQ7Z4H9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM220AQ7Z4H9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM220AQ7Z4H9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms