Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX7Q7RTT5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX7Q7RTT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX7Q7RTT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms