Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP9Q7RTR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP9Q7RTR0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP9Q7RTR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP9Q7RTR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms