Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDZD4Q76G19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDZD4Q76G19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZD4Q76G19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD4Q76G19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms