Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA1AQ71U36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA1AQ71U36 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA1AQ71U36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBA1AQ71U36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBA1AQ71U36 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1AQ71U36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms