Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBA1AQ71U36 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBA1AQ71U36 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBA1AQ71U36 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUBA1AQ71U36 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBA1AQ71U36 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBA1AQ71U36 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBA1AQ71U36 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBA1AQ71U36 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBA1AQ71U36 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBA1AQ71U36 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBA1AQ71U36 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBA1AQ71U36 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBA1AQ71U36 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBA1AQ71U36 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBA1AQ71U36 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBA1AQ71U36 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBA1AQ71U36 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBA1AQ71U36 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBA1AQ71U36 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBA1AQ71U36 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBA1AQ71U36 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBA1AQ71U36 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBA1AQ71U36 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBA1AQ71U36 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBA1AQ71U36 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBA1AQ71U36 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBA1AQ71U36 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBA1AQ71U36 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBA1AQ71U36 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBA1AQ71U36 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBA1AQ71U36 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBA1AQ71U36 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBA1AQ71U36 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBA1AQ71U36 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBA1AQ71U36 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBA1AQ71U36 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBA1AQ71U36 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBA1AQ71U36 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBA1AQ71U36 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBA1AQ71U36 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBA1AQ71U36 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBA1AQ71U36 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBA1AQ71U36 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBA1AQ71U36 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBA1AQ71U36 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBA1AQ71U36 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBA1AQ71U36 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBA1AQ71U36 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBA1AQ71U36 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA1AQ71U36 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA1AQ71U36 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA1AQ71U36 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBA1AQ71U36 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBA1AQ71U36 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBA1AQ71U36 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBA1AQ71U36 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBA1AQ71U36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBA1AQ71U36 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBA1AQ71U36 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBA1AQ71U36 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBA1AQ71U36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBA1AQ71U36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBA1AQ71U36 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA1AQ71U36 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA1AQ71U36 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBA1AQ71U36 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBA1AQ71U36 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA1AQ71U36 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA1AQ71U36 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBA1AQ71U36 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBA1AQ71U36 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBA1AQ71U36 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBA1AQ71U36 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA1AQ71U36 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA1AQ71U36 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA1AQ71U36 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBA1AQ71U36 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBA1AQ71U36 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBA1AQ71U36 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBA1AQ71U36 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBA1AQ71U36 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBA1AQ71U36 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBA1AQ71U36 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA1AQ71U36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBA1AQ71U36 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA1AQ71U36 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA1AQ71U36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA1AQ71U36 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA1AQ71U36 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA1AQ71U36 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBA1AQ71U36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBA1AQ71U36 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBA1AQ71U36 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms