Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP30Q70CQ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP30Q70CQ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP30Q70CQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP30Q70CQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP30Q70CQ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms