Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDZRN4Q6ZMN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN4Q6ZMN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDZRN4Q6ZMN7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms