Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSTM1Q6UX27 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSTM1Q6UX27 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VSTM1Q6UX27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM1Q6UX27 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms