Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSSK4Q6SA08 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSSK4Q6SA08 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSSK4Q6SA08 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSSK4Q6SA08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSSK4Q6SA08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms