Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRGCQ6NXR0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IRGCQ6NXR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRGCQ6NXR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRGCQ6NXR0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms