Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN13Q6MZZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN13Q6MZZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN13Q6MZZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN13Q6MZZ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN13Q6MZZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms