Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
B4GALNT3Q6L9W6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
B4GALNT3Q6L9W6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
B4GALNT3Q6L9W6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
B4GALNT3Q6L9W6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
B4GALNT3Q6L9W6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
B4GALNT3Q6L9W6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
B4GALNT3Q6L9W6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
B4GALNT3Q6L9W6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
B4GALNT3Q6L9W6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
B4GALNT3Q6L9W6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms