Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DIPQ5VU43 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4DIPQ5VU43 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE4DIPQ5VU43 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4DIPQ5VU43 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4DIPQ5VU43 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4DIPQ5VU43 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4DIPQ5VU43 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4DIPQ5VU43 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4DIPQ5VU43 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4DIPQ5VU43 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms