Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
L1TD1Q5T7N2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
L1TD1Q5T7N2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
L1TD1Q5T7N2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
L1TD1Q5T7N2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
L1TD1Q5T7N2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
L1TD1Q5T7N2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
L1TD1Q5T7N2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
L1TD1Q5T7N2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms