Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WASHC2DQ5SRD0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WASHC2DQ5SRD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
WASHC2DQ5SRD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms