Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC4Q5GLZ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC4Q5GLZ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HERC4Q5GLZ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERC4Q5GLZ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms