Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC45A4Q5BKX6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC45A4Q5BKX6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC45A4Q5BKX6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC45A4Q5BKX6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC45A4Q5BKX6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC45A4Q5BKX6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC45A4Q5BKX6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC45A4Q5BKX6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC45A4Q5BKX6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC45A4Q5BKX6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms