Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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