Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP13-3Q3SY46 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRTAP13-3Q3SY46 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP13-3Q3SY46 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP13-3Q3SY46 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP13-3Q3SY46 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP13-3Q3SY46 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP13-3Q3SY46 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP13-3Q3SY46 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KRTAP13-3Q3SY46 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP13-3Q3SY46 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KRTAP13-3Q3SY46 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP13-3Q3SY46 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KRTAP13-3Q3SY46 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP13-3Q3SY46 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP13-3Q3SY46 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP13-3Q3SY46 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP13-3Q3SY46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP13-3Q3SY46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP13-3Q3SY46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP13-3Q3SY46 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP13-3Q3SY46 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP13-3Q3SY46 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP13-3Q3SY46 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP13-3Q3SY46 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP13-3Q3SY46 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRTAP13-3Q3SY46 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP13-3Q3SY46 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP13-3Q3SY46 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP13-3Q3SY46 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP13-3Q3SY46 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP13-3Q3SY46 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP13-3Q3SY46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP13-3Q3SY46 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP13-3Q3SY46 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRTAP13-3Q3SY46 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP13-3Q3SY46 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP13-3Q3SY46 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP13-3Q3SY46 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP13-3Q3SY46 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP13-3Q3SY46 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP13-3Q3SY46 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP13-3Q3SY46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP13-3Q3SY46 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP13-3Q3SY46 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP13-3Q3SY46 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP13-3Q3SY46 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP13-3Q3SY46 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP13-3Q3SY46 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP13-3Q3SY46 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP13-3Q3SY46 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms