Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KIAA1644Q3SXP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1644Q3SXP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1644Q3SXP7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1644Q3SXP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KIAA1644Q3SXP7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms