Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA9Q16795 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFA9Q16795 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFA9Q16795 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA9Q16795 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms