Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LAMA4Q16363 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMA4Q16363 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMA4Q16363 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA4Q16363 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMA4Q16363 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA4Q16363 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
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