Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP1Q15431 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP1Q15431 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP1Q15431 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP1Q15431 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP1Q15431 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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