Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC41Q15345 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC41Q15345 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC41Q15345 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC41Q15345 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC41Q15345 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms