Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX17Q15036 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX17Q15036 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX17Q15036 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX17Q15036 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNX17Q15036 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
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