Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPM6BQ13491 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPM6BQ13491 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPM6BQ13491 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GPM6BQ13491 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPM6BQ13491 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPM6BQ13491 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPM6BQ13491 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms