Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNAPC2Q13487 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNAPC2Q13487 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNAPC2Q13487 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SNAPC2Q13487 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAPC2Q13487 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAPC2Q13487 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNAPC2Q13487 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNAPC2Q13487 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAPC2Q13487 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAPC2Q13487 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAPC2Q13487 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAPC2Q13487 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAPC2Q13487 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAPC2Q13487 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
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