Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MADCAM1Q13477 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MADCAM1Q13477 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MADCAM1Q13477 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MADCAM1Q13477 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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