Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
NUP160Q12769 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NUP160Q12769 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NUP160Q12769 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
NUP160Q12769 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NUP160Q12769 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
NUP160Q12769 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
NUP160Q12769 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NUP160Q12769 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP160Q12769 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP160Q12769 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NUP160Q12769 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
NUP160Q12769 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NUP160Q12769 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NUP160Q12769 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms