Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN1Q01082 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN1Q01082 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBN1Q01082 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBN1Q01082 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.8 ms