Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSF1Q00613 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSF1Q00613 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSF1Q00613 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSF1Q00613 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms