Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXK1P85037 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXK1P85037 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXK1P85037 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXK1P85037 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms