Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP1AP78559 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP1AP78559 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAP1AP78559 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MAP1AP78559 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP1AP78559 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms