Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOAP61586 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOAP61586 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOAP61586 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOAP61586 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOAP61586 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOAP61586 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOAP61586 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOAP61586 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOAP61586 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOAP61586 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOAP61586 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOAP61586 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOAP61586 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOAP61586 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOAP61586 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOAP61586 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOAP61586 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOAP61586 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOAP61586 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOAP61586 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOAP61586 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOAP61586 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOAP61586 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOAP61586 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOAP61586 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOAP61586 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOAP61586 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOAP61586 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOAP61586 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOAP61586 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOAP61586 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOAP61586 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOAP61586 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOAP61586 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOAP61586 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOAP61586 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOAP61586 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOAP61586 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOAP61586 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOAP61586 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOAP61586 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOAP61586 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOAP61586 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOAP61586 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOAP61586 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOAP61586 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOAP61586 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOAP61586 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOAP61586 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOAP61586 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOAP61586 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOAP61586 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOAP61586 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOAP61586 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOAP61586 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOAP61586 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOAP61586 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOAP61586 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOAP61586 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOAP61586 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOAP61586 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOAP61586 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOAP61586 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOAP61586 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOAP61586 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOAP61586 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOAP61586 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOAP61586 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOAP61586 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOAP61586 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOAP61586 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOAP61586 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOAP61586 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOAP61586 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOAP61586 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOAP61586 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOAP61586 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOAP61586 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOAP61586 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOAP61586 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOAP61586 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOAP61586 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOAP61586 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOAP61586 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOAP61586 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOAP61586 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOAP61586 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHOAP61586 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOAP61586 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOAP61586 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOAP61586 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOAP61586 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOAP61586 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOAP61586 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOAP61586 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOAP61586 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOAP61586 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOAP61586 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms