Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVPABLB-1P60509 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVPABLB-1P60509 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVPABLB-1P60509 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVPABLB-1P60509 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVPABLB-1P60509 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVPABLB-1P60509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms