Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC4P59998 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4P59998 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARPC4P59998 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms