Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCNP55089 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCNP55089 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCNP55089 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCNP55089 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCNP55089 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCNP55089 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UCNP55089 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCNP55089 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCNP55089 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCNP55089 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCNP55089 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCNP55089 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCNP55089 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCNP55089 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCNP55089 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCNP55089 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCNP55089 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCNP55089 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCNP55089 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCNP55089 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCNP55089 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UCNP55089 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UCNP55089 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCNP55089 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCNP55089 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCNP55089 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCNP55089 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCNP55089 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCNP55089 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCNP55089 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCNP55089 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCNP55089 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCNP55089 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCNP55089 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UCNP55089 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCNP55089 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCNP55089 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCNP55089 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCNP55089 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UCNP55089 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCNP55089 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCNP55089 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCNP55089 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCNP55089 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UCNP55089 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCNP55089 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCNP55089 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCNP55089 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCNP55089 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCNP55089 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCNP55089 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCNP55089 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCNP55089 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCNP55089 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCNP55089 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCNP55089 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCNP55089 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCNP55089 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCNP55089 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCNP55089 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCNP55089 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCNP55089 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UCNP55089 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UCNP55089 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UCNP55089 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCNP55089 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UCNP55089 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UCNP55089 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCNP55089 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCNP55089 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCNP55089 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UCNP55089 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCNP55089 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCNP55089 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCNP55089 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCNP55089 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCNP55089 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UCNP55089 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCNP55089 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCNP55089 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCNP55089 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCNP55089 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCNP55089 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCNP55089 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UCNP55089 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UCNP55089 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms