Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD4P55036 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD4P55036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD4P55036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD4P55036 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD4P55036 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms