Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MRPL12P52815 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MRPL12P52815 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPL12P52815 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MRPL12P52815 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPL12P52815 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL12P52815 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms