Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2A1P52655 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2A1P52655 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A1P52655 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF2A1P52655 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms