Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLK2P49760 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLK2P49760 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CLK2P49760 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLK2P49760 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLK2P49760 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLK2P49760 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLK2P49760 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLK2P49760 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLK2P49760 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLK2P49760 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLK2P49760 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLK2P49760 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLK2P49760 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLK2P49760 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLK2P49760 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CLK2P49760 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLK2P49760 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLK2P49760 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLK2P49760 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLK2P49760 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLK2P49760 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLK2P49760 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLK2P49760 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLK2P49760 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLK2P49760 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLK2P49760 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLK2P49760 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLK2P49760 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLK2P49760 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLK2P49760 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLK2P49760 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLK2P49760 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLK2P49760 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLK2P49760 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLK2P49760 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLK2P49760 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLK2P49760 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLK2P49760 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLK2P49760 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLK2P49760 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLK2P49760 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLK2P49760 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLK2P49760 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLK2P49760 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CLK2P49760 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLK2P49760 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLK2P49760 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLK2P49760 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLK2P49760 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLK2P49760 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CLK2P49760 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CLK2P49760 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLK2P49760 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLK2P49760 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLK2P49760 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLK2P49760 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLK2P49760 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLK2P49760 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLK2P49760 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLK2P49760 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLK2P49760 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLK2P49760 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLK2P49760 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLK2P49760 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLK2P49760 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLK2P49760 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLK2P49760 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLK2P49760 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLK2P49760 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLK2P49760 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLK2P49760 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLK2P49760 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLK2P49760 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLK2P49760 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLK2P49760 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLK2P49760 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLK2P49760 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLK2P49760 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLK2P49760 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLK2P49760 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLK2P49760 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLK2P49760 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLK2P49760 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLK2P49760 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLK2P49760 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLK2P49760 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLK2P49760 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLK2P49760 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLK2P49760 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLK2P49760 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLK2P49760 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLK2P49760 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLK2P49760 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms