Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRPPRCP42704 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRPPRCP42704 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRPPRCP42704 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRPPRCP42704 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
LRPPRCP42704 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRPPRCP42704 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313 ms