Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNB1P35222 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNB1P35222 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNB1P35222 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNB1P35222 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNB1P35222 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNB1P35222 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms