Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2H1P32780 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF2H1P32780 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2H1P32780 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2H1P32780 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2H1P32780 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2H1P32780 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms