Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LTKP29376 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LTKP29376 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LTKP29376 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LTKP29376 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LTKP29376 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
LTKP29376 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LTKP29376 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LTKP29376 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LTKP29376 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LTKP29376 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LTKP29376 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LTKP29376 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LTKP29376 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LTKP29376 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LTKP29376 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LTKP29376 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LTKP29376 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LTKP29376 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LTKP29376 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LTKP29376 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LTKP29376 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LTKP29376 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LTKP29376 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LTKP29376 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LTKP29376 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LTKP29376 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LTKP29376 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LTKP29376 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LTKP29376 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LTKP29376 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
LTKP29376 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LTKP29376 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LTKP29376 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LTKP29376 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LTKP29376 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LTKP29376 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LTKP29376 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LTKP29376 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
LTKP29376 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LTKP29376 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LTKP29376 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
LTKP29376 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LTKP29376 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LTKP29376 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LTKP29376 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LTKP29376 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
LTKP29376 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTKP29376 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTKP29376 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTKP29376 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTKP29376 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTKP29376 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LTKP29376 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
LTKP29376 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LTKP29376 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LTKP29376 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LTKP29376 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LTKP29376 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LTKP29376 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LTKP29376 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LTKP29376 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LTKP29376 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LTKP29376 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LTKP29376 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LTKP29376 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LTKP29376 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LTKP29376 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTKP29376 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTKP29376 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTKP29376 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTKP29376 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTKP29376 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LTKP29376 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LTKP29376 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LTKP29376 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LTKP29376 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LTKP29376 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTKP29376 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTKP29376 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTKP29376 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTKP29376 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTKP29376 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LTKP29376 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LTKP29376 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LTKP29376 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LTKP29376 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LTKP29376 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTKP29376 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTKP29376 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTKP29376 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LTKP29376 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LTKP29376 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LTKP29376 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LTKP29376 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LTKP29376 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LTKP29376 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LTKP29376 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
LTKP29376 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
LTKP29376 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms