Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCHP24723 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCHP24723 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCHP24723 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCHP24723 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCHP24723 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
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