Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA2P24043 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA2P24043 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA2P24043 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA2P24043 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA2P24043 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA2P24043 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA2P24043 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA2P24043 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA2P24043 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA2P24043 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA2P24043 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms